Graph:
human472-1.1a2
human472p10-1.1a2
Mtb152m-v1.1-p0a1
sj94nl-a2
sj94-a2
genes:
neighbors:
strand:
Plot setting:
merge identical paths |
filter fragmented contigs |
random color |
S CXXC1 * LN:i:618 ng:i:76 nc:i:85 c1:i:76 c2:i:0 pp:Z:CXXC1:rna-XM_032745718.2.249 S WRAP53 * LN:i:601 ng:i:37 nc:i:41 c1:i:33 c2:i:6 pp:Z:WRAP53:rna-XM_040657197.2.5430 S MBD1 * LN:i:770 ng:i:53 nc:i:53 c1:i:53 c2:i:0 pp:Z:MBD1:rna-XM_041712108.1.157 L CXXC1 + MBD1 + 0M L1:i:618 L2:i:770 L WRAP53 + MBD1 + 0M L1:i:601 L2:i:770 L WRAP53 - CXXC1 - 0M L1:i:601 L2:i:618 W AA_SRR23446543 1 AA_SRR23446543#1#h1tg000733l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,2,0 W AA_SRR23446543 1 AA_SRR23446543#1#h1tg000979l * *
CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,3,0,1 W AC_1603_72852 1 AC_1603_72852#1#h1tg000169l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,3,0,1 W AC_1603_72852 2 AC_1603_72852#2#h2tg000183l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,3,0,1 W AC_1603_72872 1 AC_1603_72872#1#h1tg000750l * *
CXXC1 lf:B:i,3 W AC_1603_72872 2 AC_1603_72872#2#h2tg000180l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,4,2 W AC_1713_89780 1 AC_1713_89780#1#h1tg000406l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,2,0 W AC_1713_89780 2 AC_1713_89780#2#h2tg000299l * * >CXXC1 lf:B:i,2 W AC_1873_10093 1 AC_1873_10093#1#h1tg000120l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,2,0,2 W AC_1873_10093 2 AC_1873_10093#2#h2tg000281l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,2,0 W AC_1873_10702 1 AC_1873_10702#1#h1tg000390l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,3,0 W AC_1873_10702 1 AC_1873_10702#1#h1tg000962l * * >MBD1 lf:B:i,3 W AC_1873_10702 2 AC_1873_10702#2#h2tg000703l * * >CXXC1 lf:B:i,2 W AC_1873_10702 2 AC_1873_10702#2#h2tg000832l * * >MBD1 lf:B:i,3 W AC_1873_10717 1 AC_1873_10717#1#h1tg000428l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,2,0,0 W AC_1873_10717 1 AC_1873_10717#1#h1tg000835l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,2,0 W AC_1873_10717 2 AC_1873_10717#2#h2tg000407l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,2,0,0 W AC_1873_10717 2 AC_1873_10717#2#h2tg000772l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,2,0 W AC_1873_10752 1 AC_1873_10752#1#h1tg000339l * * >CXXC1 lf:B:i,2 W AC_1873_10752 1 AC_1873_10752#1#h1tg000576l * *
CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,2,1,8 W AC_1873_10831 1 AC_1873_10831#1#h1tg000745l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,2,0 W AC_1873_10831 2 AC_1873_10831#2#h2tg000543l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,2,0 W AC_1873_20908 1 AC_1873_20908#1#h1tg000897l * * >MBD1 lf:B:i,1 W AC_1873_20908 2 AC_1873_20908#2#h2tg000353l * * >CXXC1 lf:B:i,2 W AC_1873_20930 1 AC_1873_20930#1#h1tg000350l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,2,0 W AC_1873_20930 1 AC_1873_20930#1#h1tg000391l * * >MBD1 lf:B:i,0 W AC_1873_20930 1 AC_1873_20930#1#h1tg000601l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,4,0 W AC_1873_20930 2 AC_1873_20930#2#h2tg000363l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,2,0 W AC_1873_20934 1 AC_1873_20934#1#h1tg000625l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,5,3 W AC_1873_20934 2 AC_1873_20934#2#h2tg000247l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,3,2 W AC_1873_20946 1 AC_1873_20946#1#h1tg000384l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,2,0 W AC_1873_20946 2 AC_1873_20946#2#h2tg000211l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,2,0,1 W AC_1873_20954 1 AC_1873_20954#1#h1tg000325l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,2,0,1 W AC_1873_20954 1 AC_1873_20954#1#h1tg000718l * * >CXXC1 lf:B:i,3 W AC_1873_20954 2 AC_1873_20954#2#h2tg000364l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,2,0,1 W AC_1873_20954 2 AC_1873_20954#2#h2tg000722l * * >CXXC1 lf:B:i,3 W AC_1873_20970 1 AC_1873_20970#1#h1tg000659l * * >MBD1 lf:B:i,4 W AC_1873_20970 1 AC_1873_20970#1#h1tg000584l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,3,0 W AC_1873_20970 2 AC_1873_20970#2#h2tg000631l * * >MBD1 lf:B:i,4 W AC_1873_20970 2 AC_1873_20970#2#h2tg000560l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,3,0 W AI_1363_74536 1 AI_1363_74536#1#h1tg000773l * * >MBD1 lf:B:i,12 W AI_1363_74536 1 AI_1363_74536#1#h1tg000397l * * >CXXC1 lf:B:i,4 W AI_1363_74536 2 AI_1363_74536#2#h2tg000486l * * >CXXC1 lf:B:i,4 W AI_1363_74537 1 AI_1363_74537#1#h1tg000518l * * >CXXC1 lf:B:i,2 W AI_1363_74537 1 AI_1363_74537#1#h1tg000160l * * >MBD1 lf:B:i,6 W AI_1363_74537 2 AI_1363_74537#2#h2tg000549l * * >CXXC1 lf:B:i,2 W AI_1363_74537 2 AI_1363_74537#2#h2tg000161l * * >MBD1 lf:B:i,6 W AI_1363_74539 1 AI_1363_74539#1#h1tg000325l * * >CXXC1 lf:B:i,2 W AI_1363_74539 1 AI_1363_74539#1#h1tg000815l * * >MBD1 lf:B:i,0 W AI_1363_74563 1 AI_1363_74563#1#h1tg000672l * * >CXXC1 lf:B:i,4 W AI_1363_74565 1 AI_1363_74565#1#h1tg000994l * * >CXXC1 lf:B:i,2 W AI_1603_79174 1 AI_1603_79174#1#h1tg000273l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,3,1 W AI_1603_79174 2 AI_1603_79174#2#h2tg000332l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,3,1 W AI_1603_79203 1 AI_1603_79203#1#h1tg000464l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,2,3 W AI_1603_79203 1 AI_1603_79203#1#h1tg000775l * *
CXXC1>MBD1 lf:B:i,2,3 W AI_1603_79203 2 AI_1603_79203#2#h2tg000743l * *
CXXC1 lf:B:i,0 W AI_1603_79218 1 AI_1603_79218#1#h1tg001334l * *
MBD1 lf:B:i,1 W AI_1603_79218 2 AI_1603_79218#2#h2tg001029l * * >MBD1 lf:B:i,1 W AI_1603_79232 1 AI_1603_79232#1#h1tg000858l * * >CXXC1 lf:B:i,3 W AI_1603_79232 2 AI_1603_79232#2#h2tg001024l * * >CXXC1 lf:B:i,3 W AI_1603_79315 2 AI_1603_79315#2#h2tg000239l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,3,6 W AI_1703_64680 1 AI_1703_64680#1#h1tg000605l * *
CXXC1 lf:B:i,3 W AI_1703_64680 1 AI_1703_64680#1#h1tg001019l * * >MBD1 lf:B:i,5 W AI_1703_64680 2 AI_1703_64680#2#h2tg000717l * * >CXXC1 lf:B:i,3 W AI_1703_64680 2 AI_1703_64680#2#h2tg000868l * * >MBD1 lf:B:i,5 W AI_1833_00513 1 AI_1833_00513#1#h1tg000871l * * >MBD1 lf:B:i,8 W AI_1833_00687 1 AI_1833_00687#1#h1tg000337l * * >CXXC1 lf:B:i,2 W AI_1833_00687 2 AI_1833_00687#2#h2tg000399l * * >CXXC1 lf:B:i,2 W AW_365326 1 AW_365326#1#h1tg000201l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,4,0,5 W AW_365326 2 AW_365326#2#h2tg000231l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,4,0,5 W AW_365327 1 AW_365327#1#h1tg000449l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,5,0 W AW_365327 1 AW_365327#1#h1tg000602l * * >MBD1 lf:B:i,9 W AW_365327 2 AW_365327#2#h2tg000360l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,5,3 W AW_365335 1 AW_365335#1#h1tg001411l * * >CXXC1 lf:B:i,1 W AW_365335 2 AW_365335#2#h2tg001409l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,3,0 W AW_365336 2 AW_365336#2#h2tg000424l * * >MBD1 lf:B:i,1 W AW_365336 2 AW_365336#2#h2tg000279l * * >CXXC1 lf:B:i,3 W AW_365337 1 AW_365337#1#h1tg000815l * * >CXXC1 lf:B:i,6 W AW_365337 2 AW_365337#2#h2tg000766l * * >CXXC1 lf:B:i,6 W AW_365338 1 AW_365338#1#h1tg000824l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,2,0,2 W AW_365339 1 AW_365339#1#h1tg000453l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,3,1 W AW_365339 2 AW_365339#2#h2tg000404l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,3,1 W AW_366487 1 AW_366487#1#h1tg001000l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,3,0,0 W AW_366487 2 AW_366487#2#h2tg000839l * * >CXXC1 lf:B:i,5 W AW_366488 1 AW_366488#1#h1tg001032l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,2,0,6 W AW_366488 1 AW_366488#1#h1tg000980l * *
CXXC1 lf:B:i,3 W AW_366490 1 AW_366490#1#h1tg001465l * *
CXXC1>WRAP53 lf:B:i,2,0 W AW_366493 1 AW_366493#1#h1tg000636l * * >CXXC1 lf:B:i,4 W AW_366493 1 AW_366493#1#h1tg000999l * * >MBD1 lf:B:i,4 W AW_366493 2 AW_366493#2#h2tg000571l * * >CXXC1 lf:B:i,4 W AW_366494 1 AW_366494#1#h1tg000689l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,4,14 W AW_366494 1 AW_366494#1#h1tg000563l * * >CXXC1 lf:B:i,5 W AW_366494 2 AW_366494#2#h2tg000688l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,4,14 W AW_366494 2 AW_366494#2#h2tg000571l * * >CXXC1 lf:B:i,5 W AW_366497 1 AW_366497#1#h1tg001075l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,3,3 W AW_366498 1 AW_366498#1#h1tg000542l * * >CXXC1>WRAP53>MBD1 lf:B:i,4,0,6 W AW_366498 2 AW_366498#2#h2tg000838l * * >CXXC1 lf:B:i,0 W AW_366499 1 AW_366499#1#h1tg000312l * * >CXXC1>WRAP53 lf:B:i,3,0 W CY_8788 1 CY_8788#1#h1tg000665l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,1,2 W CS_1 1 CS_1#1#h1tg000753l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,2,10 W CS_1 1 CS_1#1#h1tg000698l * * >CXXC1 lf:B:i,3 W CS_1 2 CS_1#2#h2tg000697l * * >CXXC1>MBD1 lf:B:i,2,10 W CS_1 2 CS_1#2#h2tg000653l * * >CXXC1 lf:B:i,3